影像-疊圖

    疊圖怎麼做？ 有沒有更簡單的方法？ 這樣的想法時，過去的電腦玩家們也有一樣的問題，並提出了解決的方法。這方法還是開源的，是每個人都可以免費使用的喔。而你所需要做的事情，就是花一點時間收尋（感謝google大神吧）。

    好的，讓我們回歸正題吧。影像疊圖，目前筆者接觸到的開源影像疊圖方法有兩種，一種叫ImageJ, 一種叫enfuse。

在筆者的測試中ImageJ的疊圖效果會有點失真，玩家們可以自己測試看看，哪一個使用起來效果比較好。

    在ImageJ部份，中文的介紹阿簡大大已經介紹過了（傳送門），在此就不再贅述。這裡要介紹的是在國外攝影玩家常用的開源方法, enfuse. enfuse 是由Andrew Mihal等開源大大所開發，因為這套軟體的疊圖相當不錯，所以目前也有很多的GUI被開發出來。linux以外的平台也可以使用（傳送門）（GUI是什麼？GUI，在我的不專業了解下，就是視窗化的軟體，簡單來說就是.... 不用打字，用滑鼠點點點就可以用的軟體）。 

     如果未來想要接觸更多的開源軟體，筆者建議可以試著接觸一些容易上手的linux作業系統分支，如ubuntu(傳送門)。目前微軟與ubuntu有合作，所以也可以考慮在微軟上安裝ubuntu，來使用下面介紹的方法。（微軟是什麼？ 欸～ 如果你買的不是蘋果電腦，基本上你的電腦裡的作業系統應該都是微軟的）

好的，以上是基本介紹，接下來讓我們看看enfuse怎麼使用吧～～

首先你要有一組需要疊圖的圖片（廢話！）

上方顯示的圖像，是針對同一個部位進行連續拍攝，但聚焦的位置不同。左上方的聚焦在靠近頭部的黑色素細胞，右下角則是聚焦在靠近嘴部的黑色素細胞。

接下來，打開linux中的terminal （終端機; 類似微軟的dos操作方式）。 如果玩家使用ubuntu，在儲存圖像的資料夾位置，右鍵點選open in terminal（用終端機開啟）。接著輸入指令：

enfuse --exposure-weight=0 --saturation-weight=0 --contrast-weight=1 --hard-mask --contrast-edge-scale=0.3 --output=base.tif SN*.tif

這裡需要注意的是那三個以不同顏色標注的數字跟文字。 褐色標示的是contrast-edge-scale的參數，紅色的是疊好的圖的檔名，藍色的是你希望處理的圖像（SN*.tif 意思為該資料夾下所有以SN開頭的tiff檔）。如果是顯微鏡拍攝的z軸照片，目前筆者測試出來可見光拍攝最好的contrast-edge-scale參數就是0.3，玩家們如果不滿意也可以再多多測試其他的參數喔。另外，指令的部份，玩家們只要先把指令儲存起來，需要用的時候，再修改複製貼上就可以了，是不是很方便？ 在做生物醫學相關的研究時，遇到需要給聽眾美美的照片時，就可以好好的利用喔。